อาสนวิหารพระนางมารีย์ในโอซากา
พระศาสนจักรโรมันคาทอลิกในญี่ปุ่นมีสัตบุรุษผู้มีความเชื่อประมาณ
509,000 คน คิดเป็น 0.5% ของประชากรทั้งหมดซึ่งมีอยู่
127 ล้านคน มี 16 สังฆมณฑล พระสงฆ์ 1589
องค์ และมีโบสถ์ 848 แห่ง
ศาสนาคริสต์
(คาทอลิก) ถูกเผยแผ่สู่ญี่ปุ่นโดยมิชชันนารีชาวโปรตุเกส และนักบวชคณะเยซูอิต
โดยนักบุญฟรังซิส เซเวียร์ (ชาวสเปน) และ อเลสซานโดร วาลิกนาโน (ชาวอิตาลี) คริสตชนชาวโปรตุเกสตั้งหลักปักฐานอยู่ที่เมืองนางาซากิเป็นที่แรก
ดังนั้นที่แห่งนี้จึงถือได้ว่าเป็นศูนย์กลางสำคัญของคริสต์ศาสนาทางตะวันออกไกลในสมัยนั้น
มีการแปลพระคัมภีร์เป็นภาษาญี่ปุ่นโดย
เฟดเดอริโก บาร์บาโร ซึ่งเป็นมัชชันนารี
ปัจจุบันนี้คาทอลิกชาวญี่ปุ่นจำนวนมากเป็นชาวญี่ปุ่นที่มีเชื้อสายมาจากชาวญี่ปุ่นที่ไปอยู่ประเทศบราซิล
มิชชันนารีได้มาถึงที่ญี่ปุ่นพร้อมกับนักบุญฟรังซิส
เซเวียร์และนักบวชเยซูอิตท่านอื่นๆ ในปี 1540
และประสบความสำเร็จในการเผยแผ่ศาสนาในเวลาไม่นาน มีผู้กลับใจราว 100,000 คน และในจำนวนนี้มีเจ้าเมือง ท่านไดเมียว กิวซู รวมอยู่ด้วย
แต่ในปี 1587 มีการเบียดเบียนคริสตชนจากจักรพรรดิญี่ปุ่น
พระองค์ต้องการให้ประเทศมีความเป็นหนึ่งเดียวกัน มีศาสนาเดียว พระองค์จึงประกาศปิดประเทศญี่ปุ่น และเริ่มทำการเบียดเบียนคริสตชนคาทอลิก ผู้มีความเชื่อต้องหลบซ่อนซึ่งเรียกว่า隠れキリシタン kakure kirishitan และมีจำนวนมากที่ยอมสละชีวิตยืนยันความเชื่อของตน ต่อมาในสมัยเมจิ คริสต์ศาสนาจึงได้รับการฟื้นฟูขึ้นใหม่ในญี่ปุ่น
